Enzym (hier Hexokinase): Wie alle Kinasen katalysiert es eine Phosphorylierungsreaktion. Das Molekül besteht aus zwei Domänen. Zwischen beiden wird eine Spalte ausgebildet, in die das Substrat genau hineinpaßt. In der Darstellung ist ein Kalottenmodell gezeigt, bei dem die Atome in ihrer vollen Größe wiedergegeben sind. Modelle dieser Art veranschaulichen, daß Makromoleküle (und auch kleine Moleküle) kompakt gebaute Gebilde sind. Sie sind aber ungeeignet, um den Verlauf der Polypeptidkette zu erkennen. Um dennoch einen Eindruck hiervon zu vermitteln, sind die Molekülabschnitte (vom N- zum C-terminalen Ende gehend, von rot über orange, gelb grün, türkis nach blau gekennzeichnet worden. (W. S. BENNETT, T. A. STEITZ, 1980)
Nach Bindung des Substrats ändert sich die Konformation des Enzyms. Die beiden Flügel verschieben sich in ihrer relativen Lage zueinander, das Substrat wird dadurch vollständig umschlossen. Wasser wird aus der Spalte völlig verdrängt. Der Platz reicht nicht einmal für ein überflüssiges Wassermolekül.
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